Здравствуйте, liht.
Рекомендуется делать той же высоты.
Если вентиляция находится в одном блоке каналов с дымоходом, то однозначно одинаковой высоты. Если это отдельностоящая труба, то она может быть вровень или ниже дымохода. Главное - чтобы она была НЕ выше дымохода. Если дымоход перетянет вентканал, то не велика беда, а если вентканал дымоход, то это беда (в прямом и переносном смысле).
А по большому счету, это вообще не важно, но при одном условии: притока должно хватать и на дымоход и на вентканал.